南京市婦幼保健院創建于1936年，前身為國立中央高級助產職業學校附設產院，現為南京醫科大學附屬婦產醫院、國家級愛嬰醫院、省內首家三級甲等婦幼保健院，集保健、醫療、教學、科研為一體，始終堅持“以保健為中心、以保障生殖健康為目的，保健與臨床相結合，面向群體、面向基層和預防為主”的婦幼衛生工作方針，常年為南京及周邊地區婦女兒童提供多層次、全方位健康保健和疾病預防診療服務，是中國醫院協會婦產醫院管理分會會員單位、中國婦幼保健協會常務理事單位、江蘇省醫院協會婦幼保健院分會主委單位。

醫院坐落于市中心，占地面積2.02萬平方米，總建筑面積10.63萬平方米，建筑面積7.5萬平方米的婦幼保健中心大樓已于2011年1月投入使用。醫院編制床位1000張，實際開放947張，現有職工總數2089人，其中高級職稱485人，碩士及以上學歷684人，博導13人，碩導83人。

醫院學科體系完善，產科、產前診斷研究室、新生兒科、婦科、麻醉科、中醫科為省級臨床重點專科，兒童保健科、婦女保健科、乳腺科、檢驗科、超聲診斷科、病理科、放射科、護理為市級臨床重點專科，婦女保健科、兒童保健科、生殖醫學、計劃生育為第三周期省婦幼保健重點學科。婦科、兒童保健科、護理部獲批市健委“基層特色科室孵化中心”。南京市婦女保健所、兒童保健所、新生兒疾病篩查中心、南京市婦幼保健計劃生育服務中心均設于院內。醫院先后獲批國家級兒童早期發展示范基地、國家孕產期保健特色專科、國家新生兒保健特色專科、國家更年期保健特色專科、國家級博士后科研工作站等。在2020年度全國三級婦幼保健機構績效考核中排名第四，獲最高等級A++；在2021年度全國三級公立醫院績效考核中位列婦產醫院（含婦幼保健院）第六，獲最優等A級，考核成績均位列江蘇省第一，綜合實力穩居全國婦幼健康領域“第一方陣”。在中國醫學科學院發布的“2021年度中國醫院科技量值排行榜”中，婦產科學第12名、整形外科第27名、麻醉學第81名。

醫院堅持科技興院，重視科研發展。2022年，立項各類課題53項，其中國家重點研發計劃子項目課題1項、國家自然科學基金項目12項；獲批成果獎8項、各類專利44項、軟件著作權5項；發表學術論文593篇，其中SCI論文145篇（IF≥5 有76篇）。

醫院倡導以人為本的服務理念，建立人性化服務體系。開創產科門診"一醫一護一診室"、產科病區母嬰床旁護理新模式，省內首開二胎咨詢門診，增設產科專病、特色門診，成立高級專家會診中心；加強病員服務中心建設，拓寬預約掛號渠道，優化分時段就診，打造微信支付平臺，升級微導診服務，加大建設復診患者綠色通道；成立國內第二家、華東地區首家純公益性質的母乳庫，推進住院早產兒或疾病患兒母乳喂養，提高母乳喂養率；推進“智慧醫院”建設，正式通過國家電子病歷系統功能應用水平分級評價五級評審；完成與江蘇省婦幼健康信息系統對接，實現產檢、分娩、兒保、計劃生育、產篩和新篩等信息互通共享；完成市醫保病案數據上傳、省醫保門診系統互聯互通、省醫保APP上線、市醫用耗材陽光監管平臺對接上報、市衛生信息數量平臺對接等工作。

作為具有部分公共衛生性質的婦幼保健院，醫院在政府職能履行方面承擔了南京地區全部包括省部屬和軍隊各級接產醫院在內的新生兒疾病篩查、助產人員技術培訓及孕產婦保健系統管理、兒童保健系統管理、孕產婦死亡、圍產兒死亡、出生缺陷和婦女病普查情況的統計、分析、上報工作；擔負全市近200家婦幼保健三級網絡機構的業務指導和管理工作；輔助各級政府婦幼保健政策的決策與制定。2022年，成立南京市托育綜合服務中心，協同推進嬰幼兒照護服務專業化、規范化發展。在婦幼衛生服務方面，醫院在出生缺陷預防干預、產前診斷、產科和婦科疾病診療、乳腺病診治、婦科腔鏡技術、婦女兒童健康促進等方面獨具特色，優勢突出，醫療保健服務輻射全省乃至外省市。

醫院秉承“厚德、愛生、精進、釋悅”之院訓，以全生命周期健康管理服務為主線，護佑婦女兒童健康為己任，高水平全面建成國內一流、特色鮮明的創新型、研究型、智慧型、舒適化婦幼保健院。